Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
6030445D17RikE9Q8F9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
6030445D17RikE9Q8F9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms