Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm20425E9Q035 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm20425E9Q035 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm20425E9Q035 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.77■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm20425E9Q035 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms