Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Trappc8E9PWG2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Trappc8E9PWG2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Trappc8E9PWG2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms