Protein–RNA interactions for Protein: E9PUB3

Gm5878, Predicted gene 5878, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5878E9PUB3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5878E9PUB3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5878E9PUB3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5878E9PUB3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5878E9PUB3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms