Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PROB1E7EW31 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROB1E7EW31 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PROB1E7EW31 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.9 ms