Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim12cD3Z3L3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim12cD3Z3L3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim12cD3Z3L3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms