Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lonrf1D3YY23 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lonrf1D3YY23 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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