Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Catsperg2C6KI89 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Catsperg2C6KI89 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Catsperg2C6KI89 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Catsperg2C6KI89 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.2 ms