Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ptprz1B9EKR1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptprz1B9EKR1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptprz1B9EKR1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms