Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Phf11bB4XVQ1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Phf11bB4XVQ1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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