Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cyp26c1B2RXA7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cyp26c1B2RXA7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms