Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtprbB2RU80 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprbB2RU80 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtprbB2RU80 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms