Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Brpf3B2KF05 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brpf3B2KF05 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brpf3B2KF05 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms