Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfx1B1AY10 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfx1B1AY10 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfx1B1AY10 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfx1B1AY10 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfx1B1AY10 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nfx1B1AY10 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nfx1B1AY10 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nfx1B1AY10 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nfx1B1AY10 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nfx1B1AY10 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms