Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nipsnap3aB1AWZ3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms