Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm436B1AVU6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm436B1AVU6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.4 ms