Protein–RNA interactions for Protein: A6X8J1

Gm16430, Predicted gene 16405, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16430A6X8J1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm16430A6X8J1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm16430A6X8J1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms