Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Herc3A6H6S0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Herc3A6H6S0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.4 ms