Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF804BA4D1E1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF804BA4D1E1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF804BA4D1E1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF804BA4D1E1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF804BA4D1E1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF804BA4D1E1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF804BA4D1E1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF804BA4D1E1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF804BA4D1E1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF804BA4D1E1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF804BA4D1E1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms