Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hacd4A2AKM2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hacd4A2AKM2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hacd4A2AKM2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms