Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdr2lA2A6T1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdr2lA2A6T1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdr2lA2A6T1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdr2lA2A6T1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.3 ms