Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDU8

Cc2d2b, Coiled-coil and C2 domain containing 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cc2d2bA0A286YDU8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Cc2d2bA0A286YDU8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC33■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cc2d2bA0A286YDU8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cc2d2bA0A286YDU8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Cc2d2bA0A286YDU8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms