Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tsc22d3Q9Z2S7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms