Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stk39Q9Z1W9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Stk39Q9Z1W9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stk39Q9Z1W9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.7 ms