Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LYVE1Q9Y5Y7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LYVE1Q9Y5Y7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms