Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRP12Q9Y561 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms