Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NOD1Q9Y239 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOD1Q9Y239 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOD1Q9Y239 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms