Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PapolbQ9WVP6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PapolbQ9WVP6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms