Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.4 ms