Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GTF2A1LQ9UNN4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GTF2A1LQ9UNN4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms