Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOX13Q9UN79 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX13Q9UN79 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX13Q9UN79 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX13Q9UN79 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX13Q9UN79 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX13Q9UN79 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX13Q9UN79 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX13Q9UN79 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms