Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYTH4Q9UIA0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYTH4Q9UIA0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH4Q9UIA0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYTH4Q9UIA0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms