Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DDX25Q9UHL0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX25Q9UHL0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX25Q9UHL0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms