Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Irx4Q9QY61 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irx4Q9QY61 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms