Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COX16Q9P0S2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COX16Q9P0S2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
COX16Q9P0S2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COX16Q9P0S2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COX16Q9P0S2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COX16Q9P0S2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms