Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZDHHC3Q9NYG2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZDHHC3Q9NYG2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms