Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRMT1Q9NXH9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRMT1Q9NXH9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRMT1Q9NXH9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms