Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNFRSF19Q9NS68 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 506.7 ms