Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO8Q9NRD0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO8Q9NRD0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms