Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH6

Txnrd1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd1Q9JMH6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Txnrd1Q9JMH6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Txnrd1Q9JMH6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Txnrd1Q9JMH6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Txnrd1Q9JMH6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Txnrd1Q9JMH6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Txnrd1Q9JMH6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Txnrd1Q9JMH6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Txnrd1Q9JMH6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Txnrd1Q9JMH6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Txnrd1Q9JMH6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Txnrd1Q9JMH6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Txnrd1Q9JMH6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms