Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trappc2lQ9JME7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trappc2lQ9JME7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc2lQ9JME7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms