Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV6

Pnkp, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkpQ9JLV6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PnkpQ9JLV6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PnkpQ9JLV6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PnkpQ9JLV6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms