Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dclk1Q9JLM8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Dclk1Q9JLM8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dclk1Q9JLM8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms