Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col5a3Q9JLI2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col5a3Q9JLI2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col5a3Q9JLI2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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