Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sh3bgrlQ9JJU8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.1 ms