Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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Bco1Q9JJS6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Bco1Q9JJS6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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Bco1Q9JJS6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Bco1Q9JJS6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Bco1Q9JJS6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bco1Q9JJS6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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Bco1Q9JJS6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bco1Q9JJS6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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Bco1Q9JJS6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Bco1Q9JJS6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco1Q9JJS6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Bco1Q9JJS6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco1Q9JJS6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco1Q9JJS6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco1Q9JJS6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bco1Q9JJS6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Bco1Q9JJS6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco1Q9JJS6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Bco1Q9JJS6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco1Q9JJS6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco1Q9JJS6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Bco1Q9JJS6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco1Q9JJS6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco1Q9JJS6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco1Q9JJS6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco1Q9JJS6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bco1Q9JJS6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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