Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc22Q9JIG7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc22Q9JIG7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc22Q9JIG7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms