Protein–RNA interactions for Protein: Q9JID9

Sh2b2, SH2B adapter protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b2Q9JID9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sh2b2Q9JID9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sh2b2Q9JID9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh2b2Q9JID9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh2b2Q9JID9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh2b2Q9JID9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms