Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LratQ9JI60 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LratQ9JI60 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LratQ9JI60 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms