Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DCLRE1BQ9H816 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DCLRE1BQ9H816 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms